וכך כותב לי הרב מתתיהו גרינבלט שליט"א מספרינג-וועלי: "בודאי ידוע למע"כ שמורנו הגר"י הוטנר ז"ל קרא למאמריו הלכות דעות וחובות הלבבות. מעניין שבמאמרו של הרב תחיית הקודש, נמצא ביטוי זה בדיוק, וברור שהרב הוטנר לקח את הביטוי הזה מהרב".
ואמנם בשנים הראשונות של עמידתו בראש ישיבת רבי היים ברלין ז"ל היה מרבה לצטט את דברי מרן הרב זצ"ל ואחד התלמידים הראשונים שלמד אז בישיבה מוסר שפעם אחת הסביר לו הגר"י הוטנר ז"ל ואמר "תודעתו של אדם דומה לבניין בעל קומות. הקומה התחתונה שלי קומת היסוד זה הסבא מסלבודקה, והקומה העליונה זה הרב קוק".
וכשהעיר פעם מישהו ואמר שהיו כמה וכמה שלא קיבלו דעותיו של הרב הגיב ר' יצחק ואמר "הרב היה גדול בתורה ביראה בחסידות מכל אלה אשר חלקו עליו".
ופעם מסר ר' יצחק תגובת הרב לגבי העובדה שיש חולקים על דרכו לקרב כל אדם מישראל "מי שהוא דובר שלום לכל זרעו, בהכרח הוא רצוי לרוב אחיו - ולא לכל אחיו". [עי' מגילה טז ב מלמד שפרשו ממנו מקצת סנהדרין].
